上記の内容でなんとかなると結論づけ。
どうしてもというなら以下を覗いて
~/.local/share/mime/application
その中のxmlの書式をコピペしてオリジナルのxmlを作成し
MIMEタイプはapplication/x-hoge-hogeと拡張子を上書きし
勝手に宣言できる。
そしてMIMEタイプエディタにはいりapplication/x-hoge-hogeをダブルクリック
ねらいのアプリを選択しておく。
こういうMIMEタイプを作成しておくことでメリットもあるが省略する。
説明しても使わないだろｗ