>>270
sid openjdk-6-jreだと、
/etc/java-6-openjdk/fontconfig.properties
このファイルでフォントが設定されてる。
東風フォント決め打ちになってるので、東風フォントの設定を参考に、
IPAフォントの設定をするといい。

sun-java6-jreだと
/etc/java-6-sun/fontconfig.properties
を編集すればいいと思う。