以下のようなシェルスクリプトで

　#!/bin/bash
　aaa='/var/www/html'
　sed -e "s/document_root/$aaa/g" target_file \
　　> target_file.modified

aaa='\\/var\\/www\\/html'
とエスケープしてやると当然ちゃんと置換してくれるんですけど、
$aaaは、おれ以外の奴にも分かりやすいようにエスケープなんかしない
実在のパスで設定できるようにしたんです。

うまい方法ご存知の諸兄、ぜひアドバイスを。