hogehoge.tar.gz とそれを展開したディレクトリ hogehoge/ を
一辺に消そうと思って、
$ rm -r hogehoge* とするところを
$ rm -r hogehoge * とタイプミス。

ぜーんぶ消えますた orz

ドットファイルがきえなかっただけまだましだけど。