突然刑事が来て逮捕される可能性もあるので放っておくべきではないだろ。
納得いかないのなら取り締まりを担当した所轄へ「証拠となる写真を見せろ」と言うといい。恐らく見せてくれるはず。
神社におまいりにいった件は自業自得なので仕方ないが、外出中に違反取られた件については
「自分は遠方に外出中だったので違反を取られていたのはあり得ない。ひょっとすると盗難されていたかも知れない」とか説明すれば不起訴になる可能性も０じゃない。