適当に調べた結果、結構変わってるっぽい
ここを見てる人は殆ど居ないだろうけどメモっとく

-ハッキング画面で組み合わせに失敗しても回転が止まらない
-ステージ01の面の構成が変わってる。
-無限弾でも残段数が表示されるようになっている。（リロードのタイミングが分かりやすい）
-タチコマステージで開始直後に操作説明が付いている。
-電通時の見た目が変わってる。
-ステージクリア時にリザルト追加。タイムなどの要素で点数が付く
--それにともなってタイムアタック的な要素とハイスコアが競える
-ステージ選択時に武器を追加選択できる
--バトーはナパームランチャーも選択できる(少佐は肩武器装備不可)
-扇子の数が増えている(各ステージ10個)
--恐らく扇子の取得数か何かでステージ選択時の武器スロットが開放される形だと思う
-難易度選択　Aggressive>HARD>NORMAL>EASY>CHAMPION
--難易度「Aggressive」だと敵の配置なども変化する。
-エレベーターは開ける時だけスイッチ操作すれば良いようになっている。

ざっとこんな感じだった