スキルは純粋に習得式にすればいいと思うけど。
ファイナルファンタジータクティクスみたいに、
一定のレベルなどの条件を満たすと自動的にスキルを習得していって、
その内から同時に５種類ぐらいを限度にして自由に付け替えできるようにして。
(当然クラスによって習得不可能なスキルもある形で)
その方が自由度が高くなってやり甲斐があるし。

それにある程度自由なクラスチェンジ後の兵種の選択を加えれば、
育成ゲームとしての楽しさはずっと増すと思うけど。
(例としては、騎士系のユニットに大剣技能を習得させて馬上で大剣を使えるようにしたり、
剣士系の軽兵に待ち伏せ、見切り、受け流し、死闘などを付けて一騎打ちの鬼にしたり、
重騎士に盾熟練と魔法回避、見切りを付けてひたすら堅くしたりなど)
ＢＳはキャラクターの能力がまるでそれぞれのマップをクリアするためだけに
最適化されて決められたみたいで、味気なかったし。