探すの面倒だから配布ページのURLくらい貼って欲しいわ

プラグイン内をSoundManagerで検索すれば、SEを鳴らしてるメソッドがGame_CharacterBase.prototype.playPopupSeだというのはすぐ分かるはず
そしたらそのメソッド内ではdamageInfo.mpFlgでmpダメージかどうかのフラグを取得できるからそれで分岐させればいい