5.3にしてから、プロジェクト選択画面で真っ黒（正確には濃いグレー）になってしまった。
同じようにそこから先に勧めないって人いる？

http://forum.unity3d.com/threads/unity3d-5-3-not-working.372682/
状況的にこれに似てる気がする。32ビット版Windowsでしか起こってないぽい？
でも自分の英語力＆Unity知識では後半さっぱり分からん。

とりあえずエクスプローラからシーンファイル（*.unity）をダブルクリックすれば、
Preferencesでプロジェクト選択画面を出す設定にしてても飛ばして起動できるのは確認した。
また、最初から飛ばす設定にしてれば問題なく起動するぽい。