膨大なゲームになればソース量も膨大になるんだしそうそう読めなくなるんだから気にすることじゃないよ
市販のアプリやゲームだって逆コンパイル（名前ど忘れした）すれば読めるのも多々あるけど、大変すぎて読む気なくなるよ？
JSファイルは縮小化すれば読み込み速度早くなり、解読も複雑化するからもし縮小化されていないなら試すといいよ