>>868
です

遅くなりましたが
色々アドバイスいただきありがとうございます。
下記のような記述で無事解決できました!

var flag : int = 0;

function Start () {
}

function Update () {
if(flag == 0){
flag = 0;
animation.CrossFade("motion_01",0.5);
StartCoroutine("Wait");
}

else{
flag = 1;
animation.CrossFade("motion_00",0.5);
}
}
function Wait(){
//motion_01の長さ分の尺
yield WaitForSeconds(5.0);
flag = 1;
}