javascriptでよければこんな風にする
マテリアル操作してるスクリプトに

var g_material: Material[];

みたいにMaterialの配列を作ってUnityでこのスクリプトを付与してるGameObjectをInspectorで表示させ
g_materialのサイズを使いたいマテリアルの数で初期化し、配列の要素にprojectからドラッグしてマテリアルを突っ込めばいい