普通に扱ってるだけならまずそんなことにはならない
戦闘コモンを弄ったつもりなくても計算式を変えるようなコモン導入してることもある
あと基本システムは名前呼び出しだから、もしDBの項目名とかを変えたりしてたらバグる

まあ本当にコモン弄ってないなら新しいのダウンロードしてきてコモン全部出力して上書きすればいい