色々やってみた
・登録キャラの一部を削除し登録位置を変える→ ×
・他の自機に問題のスプライト(以下甲)を登録→ ×
・自機に別のスプリクトを登録→ ×
・自機に既に登録してある別のスプライトを登録→○
・自機に新規作成したスプライトを登録→ ×
・オプションキャラに甲を登録→ ×
・自機以外の他のキャラに甲を登録→ ○
・甲を複製したものを自機に登録→ ×
・自機そのものを複製→ ×

何か自機とオプションのキャラに使用するキャラクタが一定数超えると
発症するような気がしなくも無い。(推定15？)
(新規でいくらキャラクタを作成してもそれをプレイヤー・オプションに登録すると皆白くなった)
なぜ12番目のキャラだったのかはよくわからないが。
(問題のスプライト登録が特別初めのほうだったり後のほうと言う訳ではない)