そもそも今の運賃計上はどういう設計になってるんだろ。
A4は、駅間を直線で結んだ距離を基準にしていて
カーブが多いほど売上が低下したと思うが。

目的地は持たなくてもいいと思うが、
例えば、列車ごとに過去停車した駅のリストを持たせるのは難しいの?
どの座標で停車したか、それぞれの駅で何人乗ったのか、過去10駅分くらいあれば。

どの駅で何人乗ったのかがわかれば
464みたいな方法と併せれば目的地を選んでるっぽい見た目にもできるし
乗車のみ設定においても、運賃計上を自然な形にできそうだし。