win32ole.dllで可能
WshShell オブジェクトのPopupメソッドを使う

Plugins.link("win32ole.dll");

Debug.console.visible = Debug.controller.visible = true;

var shell = new WIN32OLE("WScript.Shell");
var ret = shell.Popup("メッセージ", 0, "タイトルバー", 4+32);
Debug.message(@"ret = ${ret}");
invalidate shell;

引数の意味はWindows Script V5.6 ドキュメントを参照
ttp://www.microsoft.com/japan/msdn/scripting/
ここまでで理解できなかったら諦めろ