海と陸の境目を通行不可にしたらどうだろう？
通行設定って四方向で決められるじゃん
　┏↑┓
　←　→
　┗↓┛
これを
　┏↑┓　　　　　┏↑┓　　　　┏？┓
　←海？　とか　←海→　とか　←海→　とか
　┗↓┛　　　　　┗？┛　　　　┗↓┛

んで、船に乗るときは動作指定ですり抜けONにして海のチップの中に進ませる
船にグラフィックを変えてすり抜けOFFに戻す

海チップも設定では通行可能の○にしておいて
四方向の通行設定で入れなくしておけばいいんじゃない？