358氏が塗りもやるのならば1がベストだと思いますが385氏はベタ塗りと明言してます
なので作業性からも3が良いのではないかと思います。
ちなみに私はPhotoshopCS3使用です。
それから、線画は大きいままでお願いします。

さて色塗り練習は現在絵柄に合う塗り方を試行錯誤中。
コメントはもちろん、JP4A氏の絵にはこんな感じが似合いそうとかアドバイス頂けるとコートの中では平気です。

アニメ塗り? ttp://gamdev.org/up/img/10123.jpg
JP4A氏っぽく? ttp://gamdev.org/up/img/10124.jpg
水彩っぽく? ttp://gamdev.org/up/img/10125.jpg