>>357　さん

WinAPIの以下の関数を使用するとよいでしょう。
・GetKeyboardState（全ての仮想キーの状態を取得）
・GetKeyState（指定したキーの状態を取得）
これらを使用することにより、システムキーの状態も取得できるはずです。
また、Shift/Ctrl/Menu(Alt)を左右別々に取得も可能です。
ただし、システムキー「離した」という情報は取得できません。

これであれば、Alt+Enterを取得できるかと思われます。