それから僅かに残された人類はモンスターを封印する技術『ポゼストーン』を生み出し、僅かに残るモンスターの大部分をも封印した。
が、絶大な力を秘めるポゼストーンを悪用する人間、ポゼストーンによって凶暴化した人間たちもまた人類の敵として君臨するようになり、文明は静かに衰退していった……。

永い時が流れ、『時を流せし者』の分身である闇の化身が目覚める。
封印の鍵となった地水火風の武具は封印され、その化身達も闇の化身の前に敗れた。
人類に再び危機が迫る。最後の希望は水の化身、伝説の超兵器『バイク』に跨る者……『仮面ライダー』アクエス！　君だけなんだ！