古代文明の探求、はむしろ冒険ルートにこそふさわしいんじゃないでしょうか？
>>344さんの言うようなフリーダンジョンがあると楽しいと思います。
むしろそのダンジョンを奥まで進むと古代文明について色々知ることができるとか。

どちらにしろ、個人的に他のルートではあまりでしゃばってほしくない設定ではありますね。
せいぜい、ボスクラスの機体には宗教国から提供されたオーバーテクノロジーが使われていたりする、
くらいの設定でいいんじゃないでしょうか？