階層構造で2Dのフィールドなら三次元配列でデータを持たせればいいだけ。
隣は関係ない。
>普通のレイヤー付きマップエディタ
そんな正体不明な普通を持ち出されても、エスパーではないので、
どんなデータを出力するか分かるわけがない。

どうせイベントの位置指定などで独自データが必要になるので、
マップエディタぐらいは自作した方が無難。