みんなはどうなのか知りませんが自分は一つのハードディスクに2つの領域を確保して
1つ目にOS、2つ目にデータを入れるようにしています。これだとOS壊れても
データまでは被害受けにくいですから。(ちなみにOSはWin2000ですが)