プロトコル(通信規約)という言葉については以下あたりを参考に
ttp://e-words.jp/w/OSIE58F82E785A7E383A2E38387E383AB.html
ゲー製的には第４層のＴＣＰやＵＤＰがメインじゃないかな。
（WinSockやＤｉｒｅｃｔＸで間接的に…だけど）

ＴＣＰやUDPの上の層（第５層？）にプロトコルを決めるとしたら、
多人数で開発するときくらいだと思う。
よほど珍妙な事をやろうとしないかぎり、
一人で開発するのにわざわざプロトコル決定して、
検討したりする必要は無いと思う。