誰か助けてー！

僕の所属する大学のサークルで、
立体的なマップ（ポリゴン）上でバトルする
ディアブロのようなシステムの簡易アクションゲームを
企画中なのですが、、、
先日、マップに立体交差を盛り込もうとしたら
プログラマーから「立体交差は問題が多い。無理！」
と突っぱねられてしまいました。

詳しい説明をしてくれないので問題を把握できません。
立体交差で何が問題になるのでしょう？
誰か問題点を予想出来る方いらっしゃいませんか？

※マップ構造は、表示用3Dモデルと属性設定3Dモデル
（索敵などにも利用するIDマップ：非表示）を別々に持ってます。