メタルギア　ソリッド 3 　サブシスタンス』 は、『メタルギア　ソリッド 3 　スネークイーター』に収録された本編全ステージはもちろん、
前作で好評を博した「猿蛇合戦（主人公・ソリッド・スネークとピポサルの対決）」のステージ追加 、
ゲームを全部クリアすると出現する「デュエルモード（登場したボスキャラクター達との対戦プレイ）」、
「デモシアタ ー（好みのフェイスペイント、迷彩服で映像シーンを観賞できる）」など、数々の新モードを追加しました。
さらに本作では、「メタルギア　ソリッド」シリーズ の原点である MSX2 版『メタルギア』、『メタルギア 2 　ソリッド・スネーク』を復刻します。
『メタルギア　ソリッド 3 』はこれら MSX2 版以前の世界（ 1960 年代）を描いています。『 MGS3 』登場キャラクターの「その後」を MSX2 版『メタルギア』、
『メタルギア 2 　ソリッド・スネーク』で楽しんで頂こうと、この度（株）ソニー・コンピュータエンタテインメントの「プレイステーション ２」向けに完全移植しました。