>まぁ正直、屋根の勾配を取り直した方が良いと思いますがね。
>下地張って勾配2,3寸も取れば普通に問題起きないし

おっしゃるとおりですね。でも、勾配取り直すのは大変な作業だと思います。
実は、我が家にも似たような物件があります。
（３．４メートルで高低差２０センチ。下地板はなく、ポリカ波板（エンボス処理）のみ。
　ただし、奥行きは４メートル以上）
これでも、室内には、まったく漏ってきませんね。波板の重なりは、３０センチくらい取っています。
　なので、防水シートと重なりを大きく取ることでやってみてはどうですか？　それと、平トタンは
あまりお勧めしません。