大阪と京都だけなぜ「府」なのか
http://www.nikkei.com/article/DGXBZO37915860R10C12A1AA2P00/?df=2

そもそも現在は東京を首都とする法律自体がなく、政府や天皇の居所などがあることから慣習的に「首都」とされているという。

「実は維新の際、京都から東京に移るにあたって天皇は、詔を出すなど明確な形で遷都を宣言していません」と佐々木名誉教授が教えてくれた。