では。

・埼玉県本庄市の家畜市場で生きた牛等を仕入れる
・そこの合法的な屠殺場で日本の法律等とイスラムの作法に則り屠殺
・屠殺後の肉は店の裏手の作業所でイスラムの作法に則り処理

どうやら処理＝屠殺と限定解釈されたのでしょうか。
自分が書いた「処理」は、解体等の様々な作業を含みます。
それですれ違いが起こったのかもしれませんね。