>330=341
質問の意味がまったく分からないので、マニュアル読んで整理してから来てくれ。
「パターンとソングの違い」、「オーディオデータとリズムデータの違い」を理解してないと思う。
予測の範囲で答えると、、、

>330
リズムマシンとレコーダーは同期しているので、録音時にも一緒に再生される。
音を聞きたくなければリズムのフェーダーを下げればよい。
バウンスやミックスダウンじゃなければ、リズムは録音されない
（オーディオデータにはならない）ので気にするな。

>341
>自分で計算しながらやるんだろうか。録ったあとで切るとか
ここが何をしたいのかまったく分からない。
録音開始して、演奏終了から録音停止までの時間にリズムが入るのが嫌なら
素直にソングを組むか、ミックス時に良いタイミングでリズムをOFFにする。
部分的にリズムを鳴らしたくないなら、無音のパターンをソングに入れる。