なぜ切れる?で、続きだけど、適当にBATを作るべし。
C:\Program Files (x86)\TsSplitter\TsSplitter.exe" -SD -1SEG -SEP2 %1

2.音声を取り出す。
ts2aacで音声(aac)を取り出す。BATファイルは以下の通り。
-----
SETLOCAL
@echo off
rem オリジナル→ http://pc11.2ch.net/test/read.cgi/avi/1234673901/297
rem tsファイルのD&Dでts2aacを実行
SET ts2aac_exe="%~dp0ts2aac.exe"
:start
if "%~1" == "" goto end
if not "%~x1" == ".m2ts" goto next_file
cd /d %~dp1
echo %1
%ts2aac_exe% -i "%~nx1" -o "%~n1" -B -D
SET AAC=""
FOR /F "tokens=1,2* delims=:" %%i in ('type "%~n1.ts2aac.txt"') do if "%%i" == "outfile" set AAC="%%j"
if %AAC% == "" goto next_file
echo %AAC%を作成しました。
:next_file
shift
goto start
:end
echo 完了しました

ENDLOCAL
-----