リッピングは出来るが、カットした前後部分は「のりしろ」が存在していて
m2tsは実際よりも実時間が飛び飛びのデータが出来ている。
また別データで開始点、終了点の情報が入っているのはわかるよね？
それを実データのm2tsだけ治すのはけっこう面倒だよ。

自分はAnyDVDで複写化脳にして、ディスクごと複製するか
BDMV化をする市販ソフトでBDを読ませてソフトで自動で治させてから
m2tsを取り出し再BDAV化そてるw

一番いいのは素材は編集してBDに入れないこと。

(上記で開始や終了が単に移動する分には問題無、間をつまんで編集した場合のみ該当)