フィルターフックが存在しているかどうかが鍵だけど
特定のカスタムフィールドであればこんな感じでできるっぽい
http://www.sandalot.com/%E3%82%AB%E3%82%B9%E3%82%BF%E3%83%A0%E3%83%95%E3%82%A3%E3%83%BC%E3%83%AB%E3%83%89%E3%81%AE%E5%80%A4%E3%82%92%E3%80%81%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%83%99%E3%83%BC%E3%82%B9%E3%81%B8%E3%81%AE%E4%BF%9D/

あとは発想を変えて、保存はそのままで
テーマ内でカスタムフィールドの値を利用するときに変換をかけるぐらいしか