>記事の投稿時に　ＵＲＬが自動リンクされるんだけど、
>ＷＰのバージョンのいつ頃から標準装備されたの？　

MEの頃から最新の3.2までWP使ってるけどいままで一度もそんな経験ない
使用しているテーマやプラグインの機能なんじゃない？
インストール直後のデフォルトなWPで検証してみたらどうかな