うちも同じ症状が出てました。
htmlのトップページだけのカスタマイズをしてなかったですか？
デザイン→HTML一覧　の所で「デフォルトHTML」に変更してから
「すべて」を再構築すると　続き以下と、コメントは正常になりました。

承認制に関しては別件でデフォルトhtmlが直ってからですが、管理者の承認を得られるまで記事のコメントには反映されないので、
コメント一覧の管理ページで承認してみたら表示されるようになると思います。