第3回貫徹小委員会-財務会計WGの資料4より、
現行の資金の流れは、これがわかりやすいかも?

(参考)原賠機構法スキーム図(平成28年10月現在)
http://www.meti.go.jp/committee/sougouenergy/kihonseisaku/denryoku_system_kaikaku/zaimu/pdf/03_04_00.pdf#page=6