まず、

1・事情聴取を断った
2・乾電池のシモンが拭き取られていた
（これは前レスであったが工場で手袋の人が入れた電池かもしれないし、
家族などが電池を入れる時に、作業中か何かで手袋をたまたましていたのかもしれない）
3・手紙が室内で書かれていたなど、手紙の件
4・警察が来た時の父親の不可解な行動　今すぐ飛行機でなんたら

1の時点で親がとにかく怪しい
父親単独かもしれないし、父親の計画や犯行を知った母親が協力したのかもしれない
報酬がどうのこうの言って自殺した男は、たぶん偶然だと思う
別の似たような性的事件に関与してたかもしれないが、ジョンベネには直接関わってないと思う