Eee Pad Transformer TF101 JP版の最新のアップデートではバージョンはAndroid 3.2.1のままですが、以下の点が改良されました。

ビルド番号:8.6.5.21-20111216
APPのバックアップのバグを修正
ワンクリックroot対策
安定性の向上
カーネルを更新(最近のHDテレビ向けにHDMIを修正)
システムアプリ(Polaris Office, Eメールなど)のアップデート
入力のラグが減少

海外版では更に以下の更新が行われています。
ビルド番号:9.2.1.11-20120221
Android 4.0.3の新機能が搭載されました。
ASUSカスタマイズ設定が追加されました。
スクリーンショットの形式をJPG/PNGから選べるようになりました。
ASUSクイック設定お知らせパネルを使用できるようになりました。
マウスの挙動を変更できるようになりました。
アプリ”App Locker”が追加されました。
ASUS製アプリが更新されました。
Polaris Office, Splashtop Remoteが更新されました。
ウィジェット”ASUS Task Manager”が追加されました。
ライブ壁紙”ASUS Day Scene”, “ASUS My Water II”が追加されました。